CellPathfinderは、ハイスループット細胞機能探索システムCellVoyagerシリーズおよび共焦点定量イメージサイトメーター用のハイコンテント解析ソフトウェアです。
注記:
CellPathfinder のソフトウェアは横河指定のワークステーションにインストールしてご使用するときのみ動作を保証致します。お客様所持のワークステーションにもインストールしてご使用できますが、動作は保証致しません。無償お試し版などで動作を十分確認してください。横河の推奨するワークステーションは下記のとおりです。
システム要件
横河がご提供するCellPathfinderのワークステーションの仕様は下記のとおりです。
| モデル |
Dell Precision |
|
CPU |
Intel Xeon |
|
メモリ |
128 GB |
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HDD |
システムドライブ（C:） 4TB データドライブ (D:) 4TB |
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OS |
Microsoft Windows10 IoT Enterprise 64bit 日本語／英語 |
|
GPU |
Quadro P620 Quadro RTX5000 or NVIDIA RTX 4500 |
|
インターフェイス |
Mini DisplayPort x4（Mini DisplayPort to DisplayPortアダプタ付属） DisplayPort x4 |
|
モニタ |
24インチワイドモニタ 解像度1920×1200 2台 |
お客様がご自身でワークステーションをご準備される場合は下記を参考にご準備ください。
|
Resource |
ベーシックパック |
With Machine Learning オプション |
With Deep Learning オプション |
||
| ミニマム仕様※3 | 推奨仕様 | ミニマム仕様 | 推奨仕様 |
推奨仕様 |
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CPU |
Intel Xeon (PassMarkスコア※1 7389) or equivalent |
Intel Xeon (PassMarkスコア※1 8479) or faster equivalent | |||
|
GPU |
NVIDIA Quadro (PassMarkスコア※1 2263) or equivalent |
NVIDIA Quadro (PassMarkスコア※1 3469) or faster equivalent |
Quadro RTX5000 or NVIDIA RTX A4500 |
||
|
RAM |
32GB | 64GB |
128GB ※2 |
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Storage |
200MB of free disk space (Data area is required separately.) |
1st: 2TB 2nd :4TB |
|||
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Monitor |
1920 x 1080 | 1920 x 1200 x 2 | |||
|
Network |
1 node | 10GbE 1 node | |||
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OS |
Windows10 22H2※464bit | ||||
※1 PassMarkスコアはハードウェアパフォーマンスを評価するためのベンチマークの一つです。
※2 タイル画像をMachine Learningオプションを利用して解析する場合、128GBのメモリを推奨します。
※3 自動解析を行う場合は、この仕様を推奨していません。
※4 2023年11月現在の推奨バージョンになります。
ソフトウェア
下記のファイル「CellPathfinder_Installer_R3.07.01（756 MB）」をダウンロードしてください。
CellPathfinderを使用するためにアクティベーションコードが必要です。
ダウンロードしたZIPファイルを右クリックして、「プロパティ」を選択し、下図の「許可する」にチェックを入れて、「OK」ボタンを押した後に、ZIPファイルを解凍してください。
解凍フォルダ内の「インストールマニュアル（IM_80K01B02-01_010.pdf)」を参照してインストールを行ってください。
Deep Learningオプションをインストールする場合は、更に、「CellPathfinder_Installer_R.3.07.01_DeepLearning（3.69 GB）」をダウンロードし、上記と同様の手順でZIPファイルを解凍してください。
その後、解凍フォルダ内の「インストールマニュアル（IM_80K01B03-01_006.pdf）」を参照してインストールを行ってください。
ソフトをインストール・起動した際に表示されるMIDコードを、アクティベーション依頼票に記入し、メールにて弊社まで送付ください。
| CellPathfinder_Installer_R3.07.01（756 MB） | ダウンロード |
|---|---|
| CellPathfinder_Installer_R.3.07.01_DeepLearning（3.69 GB） | ダウンロード |
チュートリアル
CellPathfinderの使い方をわかりやすく説明したチュートリアルを準備しています。
| 細胞周期 | チュートリアルページ |
|---|---|
| NFkB | チュートリアルページ |
| 神経突起伸長 | チュートリアルページ |
| アクチン崩壊 | チュートリアルページ |
| HeLa(CE Bright Field) | チュートリアルページ |
| スフェロイド | チュートリアルページ |
| Angiogenesis | チュートリアルページ |
| カルシウムイメージング | チュートリアルページ |
| トラッキング | チュートリアルページ |
| タイリング&手動による領域指定の解析 | チュートリアルページ |
| Dots in Cells | チュートリアルページ |
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